Игорь Васильевич работает в ИОА СО РАН с 1984 года, после окончания Новосибирского государственного университета. Он специалист в области спектроскопии атмосферных газов, моделирования переноса радиации в атмосфере, многоволнового лазерного газоанализа. Автор более 170 научных работ.
В 2001-2003 годах Игорь Пташник в качестве приглашенного исследователя работал в университете города Рединга (Великобритания), в 2007-2011-х являлся исполнителем и координатором научного консорциума CAVIAR, объединяющего восемь научных организаций Великобритании под руководством члена Английского Королевского общества, профессора Кейса П. Шайна.
Победу на выборах директора института оптики атмосферы имени В.Е. Зуева СО РАН большинством голосов одержал в 2018 году.